Les Glénan Le littoral est victime de son succès. La fréquentation touristique, la pratique de la plaisance sont des sources de dégradation de l'environnement et notamment de la qualité de l'eau, si on n'y prend pas garde.
Il faut donc trouver un bon compromis entre le développement économique et la protection de l'environnement.
Dans les ports de plaisance, conformément au code de l'environnement, sont prévus des dispositifs de prévention et de protection en ce domaine : aménagement général pour prévenir les pollutions, mesures pour contenir les fuites d'hydrocarbures, procédures de récupération des déchets de carénage, des batteries et huiles usagées.

Les principales sources de pollution sont :
- le carénage et la peinture anti-fouling ( métaux lourds et pesticides)
- les travaux mécaniques ( hydrocarbures, huiles, solvants)
- les travaux de peinture et de réparations des coques ( poussières, solvants, peintures)

Le port de plaisance de Loctudy a aménagé une aire de carénage pour :

- mettre à la disposition des usagers un équipement conforme à la règlementation
- préserver la qualité des eaux et des milieux naturels
- éviter la contamination des sédiments

Par ailleurs le règlement du port prévoit diverses mesures que doivent observer les usagers.